لاکتوباسیلوس روتری بر روی سلول های دندریتی، سلول های T کمکی نوع  1و2  و موازنه تولید سیتوکینها در سلول های اپی تلیال روده تأثیر می گذارد. لاکتوباسیلوس روتری با تاثیر مستقیم بر روی اعصاب روده اثر نموده و دردهای احشایی را کاهش دهد.

لاکتوباسیلوس روتری می تواند با تداخل در حرکات روده کودکان، به وسیله موازنه پاسخ ایمنی، خاصیت ضدالتهابی داشته باشد.

یکی از ترکیبات ضد میکروبی تولید شده به وسیله لاکتوباسیلوس روتری، روترین می باشد که فاقد پپتید یا پروتئین مرکب بوده و در طی تخمیر گلسیرول تولید می گردد.

 در واقع روترین یک ترکیب مشتق شده از گلسيرول است که تحت شرایط بی هوازی ساخته می شود و طیف عملکردی وسیعی علیه باکتری های گرم مثبت و گرم منفی دارد تا جایی که این گستره شامل قارچ ها، مخمرها و پروتوزوآها نیز می شود.